Gestionar el estudio de los Procesos Ambientales que ocurren en los diferentes ecosistemas hídricos del país, su variabilidad espacio-temporal, la productividad biológica, los patrones de circulación en ecosistemas marinos y estuarinos, y los aspectos relacionados al cambio climático, que afectan la distribución y abundancia de los recursos pesqueros, especialmente los de interés comercial.

ROCC priorizará lo que se encuentra trabajando en el marco de: Salidas del Programa Variabilidad Climática, Aspectos Oceanográficos de Crucero de Investigación, Acidificación Oceánica, Cambio Climático, SAPO, ERFEN, y otros proyectos en los cuales ROCC esté participando.