Gestionar el estudio de los Procesos Ambientales que ocurren en los diferentes ecosistemas hídricos del país, su variabilidad espacio-temporal, la productividad biológica, los patrones de circulación en ecosistemas marinos y estuarinos, y los aspectos relacionados al cambio climático, que afectan la distribución y abundancia de los recursos pesqueros, especialmente los de interés comercial.